Flora
En los bosques de manglar predominan los mangles colorado, salado o negro y amarillo o bobo. Se han identificado 276 especies vegetales terrestres, 300 morfotipos de algas fitoplanctónicas.
La Flora en este complejo lagunar esta compuesta por las siguientes clases y sub clases de plantas, donde al caer las hojas del manglar se convierte en materia organica que es de alimentos para muchos animales que viven aquí, entre las cuales hay:
 
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Fauna
En el santuario se han identificado 144 especies de peces, 102 morfoespecies de moluscos, 140 marinas dulceacuícolas y estuarinas, 98 macroinvertebrados, 19 de mamíferos, 190 de aves.
| • Las especies dulceacuícolas más sobresalientes son la tilapia roja y el "barbul de arroyo". • Las especies nuevas identificadas en el medio fueron el "bacalao" y la sierra, de origen marino, posiblemente debido a las salinidades medias |
relativamente altas durante el año 2001.
• Entre las especies amenazadas se encuentran: la guasa lagunar, sapo lagunero, róbalo blanco, róbalo carita larga, pargo dientón, pargo cubera, sábalo, tarpón, lebranche, mero guasa, bagre, chivo cabezón, chivo mozo, pez sierra, pejesierra y pez peine, pejepeine la mayoría son dulceacuícolas y estuarinas.
• Mamíferos: El manatí, el mono cotudo, el mono cariblanco, el oso perezoso, la nutria y el tigrillo.
• Reptiles: Entre los reptiles se destacan el caimán aguja, babilla, iguana, tortugas de agua dulce "Hicotea" y marinas, lobos polleros, cascabeles, boas, mapaná rabo seco.
Dentro de la
fauna de la Ciénaga Grande de Santa Marta encontramos muchos animales, entre
las cuales hay:
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